(ㄧ)致病原
人類肺囊蟲（Pneumocystis jirovecii）
(二)流行病學
肺囊蟲肺炎分布為世界性，感染的高危險因子包括早產兒、營養不良的嬰兒；原發性免疫缺陷、感染人類免疫不全病毒、使用免疫抑制劑、惡性腫瘤、器官移植的病患，在工業化國家中，是造成感染人類免疫不全病毒病患伺機性感染的主因，在非洲及開發中國家，由於醫療資源缺乏及合併感染盛行率較高的肺結核之影響，造成發生率低估的現象。
(三)傳染方式
肺囊蟲的傳染途徑是經由空氣傳染，多年來大家比較認同的理論是感染之後，肺囊蟲會潛伏在人體中，當人的免疫系統有問題時才再度活化發病，研究顯示高達75%的人在四歲時已感染過肺囊蟲，除了潛伏再活化外也有證據顯示，人與人之間的傳播是導致新感染發生的主要模式；另外從環境中感染也是可能的。
(四)預防方法
（1）感染HIV之病患如果CD4低於200則須服用初級預防藥物(primary prophylaxis)－Trimethoprim-Sulfamethoxazole（TMP-SMX），如對TMP-SMX過敏者，可使用Dapsone。另外已感染的病患在治療後也必須繼續服用次級預防(secondary prophylaxis)，直到使用高效能抗病毒藥物(HARRT)後CD4大於200才可以停藥。
（2）免疫功能不全或受損者避免接觸感染肺囊蟲肺炎之病患。
(五)臨床症狀
（1）肺囊蟲肺炎是常見的後天免疫不全症候群的定義感染症(AIDS-defining illness)，大部份發生在HIV感染後CD4下降到200以下的病人。
（2）病患主要的症狀表現是漸進性的呼吸短促、發燒、乾咳，其他症狀包括胸痛，極少數會咳血；幼童重症者可能產生發紺、鼻翼扇動和肋間凹陷。
（3）胸部X光檢查典型上，會呈現雙側從肺門向周圍延伸的瀰漫性浸潤。
（4）實驗室檢查常可發現血液氧飽和度下降，另外也常見乳酸脫氫脢(LDH)升高。
（5）肺部以外的感染可能產生甲狀腺腫大、骨髓侵犯造成全細胞減少、眼脈絡膜病變、外耳道息肉樣變化、肋膜積液；脾臟、肝臟、腎臟和腎上腺侵犯等症狀。