（一）疾病確認
沙門氏菌感染症為食因性感染的疾病，亦為人畜共通傳染病，主要因食入遭受動物糞便污染的食物而感染，一般臨床症狀以急性腸胃炎表現，在感染後約6-48小時會有噁心、嘔吐及下痢等，伴隨發燒及腹部絞痛等症狀，通常發燒72小時內會好轉，腹瀉3-7天內會變好，不過約5%腸胃炎的病人會發生菌血症，其中5-10%的病人會發生轉移性的局部感染，例如：蕈狀血管瘤 ( mycotic aneurysm )、骨髓炎、關節炎等，有時候也會發生肝脾等處的膿瘍。嬰兒、老年人或免疫功能低下者症狀通常較嚴重，易因菌血症引發其他嚴重併發症。診斷以糞便或血液培養能分離出沙門氏菌作為確診。
（二）致病因子
致病原為沙門氏菌，屬於腸內細菌科、沙門氏菌屬，沙門氏菌共有2400多種血清型，其中超過200種血清型對人具有病原性，傷寒菌亦屬沙門氏菌屬，但在此指一般非傷寒之沙門氏菌。
（三）發生情形
沙門氏菌感染症屬全球分布，在已開發國家（除非有很好的通報系統）大部分的臨床病例沒有被通報，通報率低於1%，病例最常發生於嬰兒和五歲以下小孩。大約60%~80%的病例屬於散發病例，其他病例為爆發流行，小的流行通常發生於一般人群，大的流行則常見於兒童醫院或機構、餐廳及護理之家等人口密集機構，大部分的發生原因是食物來源遭受污染，少數是因帶菌者污染食物，或人與人直接糞口接觸引致。本病較易發生在7月~10月，氣候溫暖的季節，目前在世界許多國家的發生率有增加的趨勢。
（四）傳染窩
動物及人類，動物例如：家禽、豬、羊、馬、牛、齧齒動物及寵物（鬣蜥蜴、烏龜、小雞、蛇、狗、貓…）等。人類慢性帶菌者較少，但在動物及鳥類較為普遍。
（五）傳染方式
食入被動物或人類糞便污染的水或食物，受污染的食物例如：生的或未煮熟的雞蛋/雞蛋製品、牛奶/牛奶製品、肉類/肉類製品等，若食物保存不當，沙門氏菌易在高溫下大量繁殖，更易傳播。少數散發病例為接觸寵物而感染，有一些群突發與被污染的生菜或水果有關。農場的動物因食用被污染的飼料而感染，而在飼養或屠宰過程中散播病菌。人與人之間糞口傳染途徑也很重要，特別是在病人腹瀉時，如果是嬰兒或糞便失禁的成人，其傳染力比無症狀帶菌者更高。
（六）潛伏期
潛伏期6-72小時，通常是12-36小時。
（七）可傳染期
糞便排菌的時間通常為數天到數週，有些可能數月（特別是嬰兒）。依所感染的血清型別不同而有差異，大約1％的成人及5％小於5歲的小孩可能排菌超過1年。
（八）感受性及抵抗力
胃酸缺乏者、接受制酸劑治療者、胃切除者、服用廣效抗生素治療者、癌症患者、接受免疫抑制劑者、虛弱的人（包括營養不良）較易被感染。疾病的嚴重度和感染的血清型別、食入的菌量及宿主因素有關。

（一）WHO食品安全五要訣：
1.保持食品清潔。
2.生食熟食要分開。
3.食物要完全煮熟（尤其是雞蛋與家禽肉類）。
4.食物保存在安全的溫度。
5.使用安全的飲用水與食品。

（二）一般防治措施：
1.烹調食物前或餐前便後應確實洗手，小心處理食物。
2.食物應以保鮮膜包裹後置入冰箱，再次食用前應加熱煮熟。
3.沙拉及冷盤之保存應特別謹慎。
4.被蒼蠅沾染、過期或腐敗等不潔食物，均應丟棄，切勿食用。
5.牛奶和奶製品應滅菌後再食用。
6.水塔應經常清洗及消毒，旅行或野營時，用水應煮沸消毒。
7.水泥砌磚水塔若已生苔，請儘可能更換成不銹鋼製品，以維護飲水衛生安全。
8.確實撲滅並阻隔蒼蠅等病媒，垃圾應加蓋並定時清除。
9.如有嘔吐、腹瀉或發燒等病徵，應儘速就醫，並避免處理食物，以防傳播他人。

一般針對沙門氏菌造成的腸炎不需要給予抗生素治療，因此，腸胃炎的治療以補充水分及電解質為主。不過一些特殊病患，例如：新生兒（小於三個月大）、大於五十歲以上的長者、器官移植患者、血液腫瘤患者、HIV感染者、有人造植入物的病人(人工血管、心瓣膜、人工關節等)、以及鐮刀型貧血患者，若出現持續性高燒、疑似菌血症或腸道外感染的情況，則應接受抗生素治療，以避免發生移轉性的感染。